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最新论文

成功构建幼龄反刍动物瘤胃微生物基因组

发布时间：2024-10-28 点击量：【字体：大中小】

题目：Seven hundred and ninety-seven metagenome-assembled genomes from the goat rumen during early life

作者：Tao Ma, Yimin Zhuang, Wei Lu, Yan Tu, Qiyu Diao, Xia Fan& Naifeng Zhang

刊物名称：Scientific Data

发表年份：2024

摘要内容：宏基因组分箱技术是一种无需培养即可恢复完整（或接近完整）微生物基因组的技术，已成为探索微生物组成与功能必不可少的手段。近年来有大量利用宏基因组分箱技术分析成年反刍动物瘤胃微生物MAG组成的研究，然而在幼龄反刍动物上未见研究报道。该团队对从出生到84日龄的42只山羊羔羊瘤胃微生物进行了宏基因组测序，自主完成了数据的质控、去宿主序列、宏基因组组装、宏基因组分箱等分析，并以序列污染度<10%、完整度>80%为判定标准，得到了797个MAG，其中包含169个高质量MAG（序列污染度<5%、完整度>90%），为进一步解析幼龄反刍动物瘤胃微生物组成、功能基因表达以及相关微生物的分离培养提供了基础支持。

瘤胃微生物基因组-所网.jpg

原文链接：https://doi.org/10.1038/s41597-024-03703-4

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