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科研进展

成功构建幼龄反刍动物瘤胃微生物基因组

发布时间：2024-08-28 点击量：【字体：大中小】

近日，中国农业科学院饲料研究所反刍动物营养与饲料创新团队基于宏基因组分箱（metagenomic binning）技术，成功构建了山羊羔羊瘤胃微生物基因组（metagenomic assembled genome，MAG），为通过早期调控反刍动物瘤胃微生物组成和功能，促进动物健康和提高未来生产性能提供了基础支持。相关研究成果发表在《科学数据（Scientific Data）》上。

宏基因组分箱技术是一种无需培养即可恢复完整（或接近完整）微生物基因组的技术，已成为探索微生物组成与功能必不可少的手段。近年来有大量利用宏基因组分箱技术分析成年反刍动物瘤胃微生物MAG组成的研究，然而在幼龄反刍动物上未见研究报道。该团队对从出生到84日龄的42只山羊羔羊瘤胃微生物进行了宏基因组测序，自主完成了数据的质控、去宿主序列、宏基因组组装、宏基因组分箱等分析，并以序列污染度<10%、完整度>80%为判定标准，得到了797个MAG，其中包含169个高质量MAG（序列污染度<5%、完整度>90%），为进一步解析幼龄反刍动物瘤胃微生物组成、功能基因表达以及相关微生物的分离培养提供了基础支持。

图片-基于宏基因组分箱技术分析羔羊瘤胃微生物组成-所网.jpg

该研究得到中国农业科学院科技创新工程、基本科研业务费专项和国家肉羊产业技术体系的支持。

原文链接：https://doi.org/10.1038/s41597-024-03703-4

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